水中的氮、磷污染主要表現為水體富營養化。水體中氮、磷含量與富營養化程度密切相關，一般來說，水體中總磷和總氮分別超過0.05mg/L和1.0mg/L，就認為水體處于輕度富營養化狀態。水體維持較高的氮、磷總量，主要是由種植業施用的氮磷肥、農業廢棄物、生活污水和造紙、制革、印染、食品等工業廢水大量排入水體引起的。另外，對于富營養化湖庫、海灣等緩流水體，沉積物內源氮、磷的釋放也是水體氮、磷的重要來源之一，造成富營養化、藻類水華形成。

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 磷是引起水體富營養的根源，雖然城市污水的磷含量很低，但是其排放水量極大。如未經處理直接排除水體，將會嚴重污染水環境。